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安捷倫氣相色譜質譜聯用儀離子源以電子轟擊電離（EI）或化學電離（CI）模式工作。樣品從 GC/MSD 接口進入離子源。燈絲發射的電子由磁場引導進入離子化室。高能電子與樣品分子相互作用，使之離子化和碎裂。推斥極的正電壓將正離子推向透鏡組, 這里它們要經過幾個靜電透鏡。這些透鏡將離子聚焦成離子束，然后進入質量過濾器。 電子轟擊 (EI) 和化學電離 (CI) 離子源。
安捷倫氣相色譜質譜聯用儀離子源特性
更換有劃痕的透鏡和其他離子源部件是很有必要的。
有劃痕的離子源部件會導致性能下降。
不要用砂紙或超聲波清潔絕緣體。
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